Gon Freecs, un joven muchacho que vive en una pequeña isla, aprende que su padre es un hombre muy famoso y se ha convertido en un asombroso cazador. Gon toma el examen de cazador para buscar a su extraordinario padre, pero en el camino mientras hace equipo con otros 3 candidatos de cazador, Kurapica, Leorio, y Killua, aprende que hay mas que el convertirse en cazador y que los retos enfrenta serán mas grandes de lo que pudiera imaginar.

Gon y Killua ayudan a Kurapica a buscar a la banda de la araña para completar su venganza por los horrores cometidos en el pasado a su tribu.

Para continuar con sus aventuras de buscar a su padre, Gon Freecs y su amigo Killua entran en el mundo de Greed Island (Isla de la Codicia), un video juego el que el padre de Gon ayudo a crear. Una ves dentro del juego, Gon y Killua se enfrentan a nuevos enemigos.

Las aventuras de Gon y Killua a través de Greed Island continúan. Buscando a su padre, Gon deambula en Greed Island hasta que conocen a Bisuke. Bisuke funciona como su maestra y entrena a Killua y a Gon y los ayuda a desarrollar sus habilidades. Los tres encuentran muchos problemas, y pistas del paradero de Ging el padre de Gon.